【摘 要】
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以E-Dragon软件计算的RDF,WHIM,Topological,2D-autocorrelation,Geometrical,3D-MORSE和GETA-WAY等7种QSAR建模常用的分子描述符为结构参数,分别在PSO算法筛选变量的基础上,
【机 构】
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西华师范大学应用化学研究所,四川,南充,637009
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以E-Dragon软件计算的RDF,WHIM,Topological,2D-autocorrelation,Geometrical,3D-MORSE和GETA-WAY等7种QSAR建模常用的分子描述符为结构参数,分别在PSO算法筛选变量的基础上,再以v-SVM算法对36种1-芳基-四氢异喹啉类化合物的抗HIV活性药物进行定量构效关系(QSAR)研究.7种分子描述符建立的PSO-v-SVM模型中,以RDF描述符建立的模型最佳.该模型对训练集和预测集计算结果的平均绝对误差MAE分别为0.0028和0.0630,决定系数R2分别为0.998和0.956;而文献[1]3个模型训练、预测结果的MAE分别为0.0612,0.5486,0.0557,0.5676和0.0665,0.5658,训练结果的R2分别为0.9493,0.9533和0.9286,预测结果的R2则均小于0;研究表明,该QSAR模型明显优于文献[1]的3个模型.
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