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综述了烟草种质资源分子标记与配合力遗传效应研究进展,并对存在问题进行了讨论,提出了:(1)在重视种质资源搜集、保存的同时,深化遗传资源鉴定与利用,发掘现有各类烟草种质资源有利基因和特异种质,拓展烟草遗传改良亲本的来源;(2)充分了解亲本之间的遗传差异,选配出强优势杂种组合,促进烟草杂种优势研究的发展;(3)加强DNA分子标记技术与烟草杂种优势利用的基础理论研究,拓展DNA分子标记技术在烟草上应用的广度和深度。