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针对区域水安全系统中存在的不确定性问题，运用集对分析理论对其评价进行了研究。利用联系度的概念去描述评价体系中的不确定性关系，挖掘问题中包含的信息。利用集对分析方法不仅能全面反映区域水安全状况，还可以避免评价过程中权重确定困难的问题。应用该方法对山东省的水安全状况进行了评价分析，并与模糊综合评价、物元分析的评价过程和结果进行了对比。结果表明，该方法简单实用、结果可靠，是有效的水安全评价分析工具。