【摘 要】
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为了获得红掌转录组数据及预测佛焰苞颜色差异关键基因功能.本研究以红色和粉色'阿拉巴马'红掌的佛焰苞为材料,通过Illumina HiSeqTM 2000高通量测序技术平台进行转录组测序,
【机 构】
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三明市农业科学研究院,三明,365509;厦门市农业技术推广中心,厦门,361009
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为了获得红掌转录组数据及预测佛焰苞颜色差异关键基因功能.本研究以红色和粉色'阿拉巴马'红掌的佛焰苞为材料,通过Illumina HiSeqTM 2000高通量测序技术平台进行转录组测序,获得28 219 907个Raw reads,组装后将All-Unigene与NR、NT、PFAM、KOG/COG、Swiss-Prot、KO/KEGG和GO数据库比对,共有138 696条Unigene对应的功能信息,其中37 073条Unigene被注释到NR数据库,显示与油棕、海枣等物种具有一定的相似性;有14 586条被注释到KOG数据库,根据功能将其分为26类;有30 580条Unigene获得GO注释信息,根据GO功能分为三大类,包含57个功能分支;有14 326个Unigene被注释到KEGG代谢途径中,分属于32个代谢通路,包括苯丙素的生物合成、谷胱甘肽代谢、苯丙氨酸代谢、ABC转运蛋白、类黄酮生物合成,其中黄酮和黄酮醇的生物合成和异黄酮生物合成等与花青素代谢密切相关.本研究结果对红掌佛焰苞花色苷形成相关基因的研究及分子标记开发等研究有一定指导意义.
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