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使用后的手术器械污染较重，许多器械上都带有血迹、脓迹、干燥的排泄物和分泌物等残留，若清洗不彻底会给后续的灭菌带来困难甚至造成灭菌失败，因此，彻底的清洗是保证手术器械灭菌成功的关键，也是预防医院感染的重要环节。目前，手术器械的清洗方法主要分手工清洗和机器喷淋清洗（或喷淋-超声波混合清洗），由于受经济条件制约，国内多数医院清洗手术器械以手工为主，仅部分大中型医院以机器喷淋清洗为主，其各自的清洗效果在近年的文献中争议较多。