S-SAP分子标记开发及其在苹果芽变鉴别上的应用

来源 :植物遗传资源学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:debug_core
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
S-SAP(特异序列扩增多态性,Ssequence specific amplification polymorphism)是一种基于反转录转座元件的广泛应用于生物遗传多样性研究的分子标记。本研究从34对引物中筛选出7对具有谱带清晰、多态性高的引物组合,成功地开发了苹果基因组的S-SAP分子标记。27个元帅系芽变品种中,共扩增出588条谱带,每对引物组合平均扩增出84条谱带,其中多态性谱带48条,多态性谱带占总扩增出谱带数的8.2%,遗传相似系数介于0.73~0.90之间。对15个苹果芽变品种进行S-SAP分析,相似系数在0.42~0.94之间,以相似系数0.80为阈值,可以区分各芽变品系。开发的S-SAP分子标记可以有效地将苹果芽变品种区分,并为苹果生物遗传多样性与系统进化、品种鉴定提供新方法。 S-SAP (Ssequence specific amplification polymorphism) is a molecular marker widely used in biological genetic diversity based on retrotransposon elements. In this study, we selected seven pairs of primers with clear bands and high polymorphism from 34 pairs of primers, and successfully developed the S-SAP molecular marker of apple genome. A total of 588 bands were amplified in 27 Marshal germplasms, with an average of 84 bands per primer pair, of which 48 were polymorphic and the total polymorphism bands were amplified 8.2% of the number of bands, genetic similarity coefficient between 0.73 ~ 0.90. S-SAP analysis of 15 apple bud varieties showed that the similarity coefficients ranged from 0.42 to 0.94, and the similarity coefficient of 0.80 was the threshold value to distinguish the bud varieties. The developed S-SAP molecular marker can effectively differentiate apple bud varieties, and provide a new method for apple biological genetic diversity and phylogeny and species identification.
其他文献
分析机内测试(built—intest,BIT)技术发展趋势和技术特点,从系统设计、信息处理到综合决策各阶段对BIT中人工智能技术(专家系统、人工神经网络、模糊理论、信息融合等)的应用进行综合分析,建立智能BIT的
在许多像计算机远程控制和数据采集这样的应用系统中,通信模块是必不可少的。实现它的模块化设计,能够极大地减轻系统的设计工作。结出了一个通用远程通信模块的电路设计和工作
为探索2011年年底在广东阳江地区某肉鸭场出现的病鸭和死鸭的发病原因,对其中2个发病鸭场的病死鸭进行了解剖,对病变组织的样品应用RT-PCR的方法进行了病原鉴定.经剖检,发现
试验用SSR分子标记对60份宁夏粳稻种质资源进行遗传多样性分析。103对SSR引物表现多态性的有58对,共扩增出212条多态性条带,等位变异范围为2~9,平均每对引物3.7个;多态性信息
干旱是影响玉米生产的主要因素之一,培育耐旱品种可以有效地保持其在干旱环境下的产量稳定性。随着生物信息学数据库的不断完善及基因组学技术的发展,耐旱通用QTL(Quantitati
利用SSR标记分析陆地棉野生种系的遗传多样性,对材料间相似系数的变异系数进行显著性测验和矩阵相关性测验,探讨引物和多态性位点数对研究结果准确性的影响。90对多态性引物
本研究选用旱稻、R974//R974/东乡野生稻回交重组自交系及其亲本等66份水稻材料,进行苗期抗旱性鉴定及其综合指标筛选,测定了水分胁迫下最大根长、根基数、茎长、根干重、根
以来自11个省份的134个小麦品种为试验材料,于2009-2010年在石家庄种植,调查冻害情况;并利用分子标记鉴定VRN-1等位基因组成,以明确小麦品种春化VRN-1等位基因组成与耐寒性的
以11个苹果品种为试验材料,根据保守氨基酸序列“FTQQYQ”和“anti-1/WⅠPNV”设计苹果自交不亲和基因引物,利用酶切分析和目的片段DNA测序方法鉴定了9个新的S-等位基因,将该
基于黄瓜基因组重测序结果,搜索InDel位点,按照每隔1~3M个碱基对的距离选择并设计遍布全基因组的代表性InDel引物134对,以16份黄瓜典型种质检测其有效性。结果显示,134对引物