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高校企业改制是适应市场经济发展的必然趋势,经过几年的改制,大部分高校已组建起经营性资产管理公司,经营性资产管理公司除了作为高校和企业间的防火墙外,更大的责任是担负起高校科研成果转化、技术孵化、教学延伸以及产学研结合的校企合作任务,本文就如何在这一新型企业制度下做好财务管理工作进行了深入细致地分析和探讨,在分析高校经营性资产管理公司现状及存在问题的基础上,提出了解决问题的几点对策。