【摘 要】
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CAX (Ca2+/H+ exchanger antiporter)是一类重要的跨膜转运蛋白,在调控植物Ca2+平衡,参与转运重金属离子中具有重要作用.研究丹参CAX家族基因的结构特征及表达特征有助于解析
【机 构】
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陕西省西安植物园,陕西省植物研究所,陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心,西安,710061;陕西学前师范学院生命科学与食品工程学院,西安,710100
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CAX (Ca2+/H+ exchanger antiporter)是一类重要的跨膜转运蛋白,在调控植物Ca2+平衡,参与转运重金属离子中具有重要作用.研究丹参CAX家族基因的结构特征及表达特征有助于解析其功能.为揭示丹参CAX家族的功能,本研究运用生物信息学方法,结合丹参基因组和转录组鉴定出7个CAX家族成员.分析其编码蛋白质的理化性质、结构特征及亚细胞定位,以及不同组织中基因表达水平.结果 显示,丹参CAX基因家族共包含7个成员,编码228～731个氨基酸,均为疏水性跨膜蛋白,二级结构以α螺旋为主,三级结构全为单体.亚细胞定位预测显示SmCAX蛋白主要分布在质膜或内质网膜上,其它部位也有少量分布.表达模式分析结果显示,丹参CAX家族成员表达模式差异较大:SmCAX3和SmCAX6在各组织中表达丰富,表达模式相似;SmCAX2和SmCAX5在叶组织中高表达,有明显的组织特异性;而SmCAX1与SmCAX4在野生丹参与栽培丹参中表达模式相反.本研究为今后深入阐释丹参CAX基因家族的功能提供了理论基础,并为运用基因工程技术改良丹参品质提供参考.
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