基于基因扰动及变分逼近技术的基因调控网络推断

来源 :东南大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wtwl66
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为了有效提高基因调控网络推断的精度,基于基因表达数据和基因扰动数据,将基因调控网络建模为结构方程模型,并进一步转化为验证性因子分析(CFA)模型,然后使用贝叶斯方法求解 CFA 模型参数。在贝叶斯分析中,为减少计算量,不采用常用的马尔科夫蒙特卡洛抽样方法,而是采用变分逼近技术对参数的联合后验分布进行因式化,并获得参数的后验包含概率分布及参数的后验分布。同时使用重要性抽样技术对 CFA 模型的推断参数进行加权平均。仿真结果表明,CFA 模型和变分逼近技术是有效和可靠的。根据实验数据,使用所提算法推导了具有3
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