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地球同步轨道(GEO)卫星通信系统具有通信时延长的特点，适用于GEO卫星长期演进(LTE)通信的资源调度算法非常重要。为提升星上资源分配的高效性，基于可变最大加权时延优先(M-LWDF)算法，提出了一种综合考虑媒体接入控制(MAC)层参数和应用层参数的跨层调度算法。该算法在MAC层从数学角度推导，提出权重更大的时延判决因子及在应用层根据业务优先级不同引入Q因子。仿真结果表明，与M-LWDF算法相比，不同业务情况下，跨层资源调度算法减小了通信时延，提高了系统吞吐量，但公平性能略有下降并增加了复杂度。