采用走航连续观测系统分别在2011年5月和2015年5月对南海北部表层水体温度、盐度、溶解氧、叶绿素a和pCO₂进行了现场观测.在El Nio影响下,2015年5月华南地区及广东省降雨量偏多,大量冲淡水入海,南海北部冲淡水区域海表盐度显著降低,2015年5月冲淡水区域海表盐度平均值为（28.05±6.18）,低于2011年5月的海表盐度平均值（29.65±2.58）,同时实测冲淡水区域海表温度平均升高约2.10℃.冲淡水携带的营养物质和适度升高的海表温度共同促进了冲淡水区域浮游植物的繁殖.浮游植物光合作用不断地将海水中的游离CO2转化为有机碳,同时释放出氧气,使得水体pCO₂降低,2015年5月冲淡水区域pCO₂平均值为（286±95）μatm,低于2011年5月的pCO₂平均值（300±42）μatm.2015年5月实测获得离岸海域pCO₂平均值为（421±9）μatm,高于2011年5月pCO₂平均值（386±13）μatm,二者差值为35μatm,海表温度是离岸海域pCO₂的主要影响因子,2015年5月El Nio期间离岸海域SST升高1.96℃.El Nio影响下冲淡水区域的碳汇作用增加,离岸海域的碳源作用增强,冲淡水区域碳汇增加与离岸海域碳源增强基本抵消,2015年5月南海北部整体仍是CO₂弱汇区,约为-0.40 mmol·m^-2·d^-1,与2011年5月通量值-0.58 mmol·m^-2·d^-1差别不明显.