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运用分子动力学和MM-PBSA相结合的方法预测β-环糊精和雌二醇包结模式。通过MD轨迹分析，不论是A-up取向还是D-up取向，雌二醇都可以和β-CD形成稳定的包结；通过氢键占有率的分析，发现β-CD的构象发生一定程度的变化。MM-PBSA计算结果表明，A-up取向包结自由能更低，为优势包结模式。进一步分析各个能量项可得，范德华相互作用能为包结的主要驱动力。