【摘 要】
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SSR可以分为完整型(不间断单一型)和不完整型(包含不间断复合型、间断单一型、间断复合型)。本研究旨在分析杉木(Cunninghamia lanceolata)不完整型EST-SSR特征。结果表明:转
【机 构】
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广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局中南速生材繁育实验室广西优良用材林资源培育重点实验室
【基金项目】
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广西自然科学基金项目(2015GXNSFBA139107);广西林业科技项目(桂林科字[2016]第36号);广西林科院基本科研业务费专项(林科201608号);广西优良用材林资源培育重点实验室自主课题(16-A-03-02)
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SSR可以分为完整型(不间断单一型)和不完整型(包含不间断复合型、间断单一型、间断复合型)。本研究旨在分析杉木(Cunninghamia lanceolata)不完整型EST-SSR特征。结果表明:转录组搜索出5 999个不间断单一型EST-SSR,占全部EST-SSR的97.78%,不完整型所包含3种类型EST-SSR的数量接近,SSR数量之和为136个,仅占转录组全部EST-SSR的2.22%。在杉木136个不完整型EST-SSR中,共有单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、六核苷酸等5种基元重复类型。不间断复合型EST-SSR中基元重复类型的组合数最多,出现了7种组合,间断复合型出现5种组合,间断单一型出现3种组合。
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