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随着我国学位与研究生教育走过了从无到有、快速发展的30余年不平凡历程，上海交通大学医学院的研究生教育也取得了迅速发展和长足进步。尤其是2005年上海交通大学与上海第二医科大学合并后，医学院体量进一步增大，医学院研究生教育进入了一个新的发展时期，研究生年招生规模突破千人。同时，研究生教育的基础条件、科研实力、指导能力、培养水平和教育质量得到了全面提升。在此基础上，2008年起，医学院以“211工程”三期建设为契机，以“质量与创新”为主题，狠抓内涵建设，通过实验技能信息化平台建设、国（境）外访学与提升计划和优