采用生物信息学方法筛选与肺腺癌患者预后相关的LncRNAs

来源 :国际检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：assofour

【摘要】

：

目的采用生物信息学的方法探讨差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)与肺腺癌患者预后的关系。方法从国际肿瘤数据库(TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织的RNA测序数据和患者的临床信

【作者】

：

陶冶李云慧黄俊杰梁彬

【机构】

：

中国医科大学生命科学学院生物信息学教研室,北部战区总医院和平院区检验科

【出处】

：

国际检验医学杂志

【发表日期】

：

2019年13期

【关键词】

：

肺腺癌长链非编码RNA 生物信息学国际肿瘤数据库

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(81301835)

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目的采用生物信息学的方法探讨差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)与肺腺癌患者预后的关系。方法从国际肿瘤数据库(TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织的RNA测序数据和患者的临床信息,采用R语言程序包筛选差异表达的lncRNAs。应用Kaplan-Meier生存曲线(Log-Rank检验)及Cox回归模型进行预后分析。结果筛选出差异表达lncRNAs共计168个,其中上调的lncRNAs有128个,下调的lncRNAs有40个。单因素和多因素回归分析结果显示:RP11-490M8.1(P=0.047)、R

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