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与其他重大专项不同的是：“重大新药创制”从网络中关键字搜索，搜索结果中排在前列的是药企。由此可见，在本专项中药企所占的重要位置。全国人大常委会副委员长、“重大新药创制”综合论证专家委员会主任委员桑国卫院士在2008年6月一次会议中对专项解释如下：该重大专项分为3个实施阶段：2008年一2010年，2011年-2015年，2016年-2020年。到2010年，专项计划自主研制出50个创新药物，其中应有部分药物得到国际科学界和市场的承认。