【摘 要】
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出生体重是影响仔猪质量和存活的一个重要性状.本研究利用206头藏猪仔猪群体,提取耳组织样品DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型填充后,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS),筛选该群体的出生重性状相关基因.结果显示:GEMMA软件共检测到5个达到染色体显著水平(P<5.6*10-6)的SNP位点,筛选了TMC1、PRUNE2、FOXB2、XIRP2、ENSSSCG00000005264、ENSSSCG00000022408和ENSSS?CG0000003024
【机 构】
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广东省农业科学院动物科学研究所,畜禽育种国家重点实验室,广东省动物育种与营养公共实验室,广东省畜禽育种与营养研究重点实验室,广东广州510640
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出生体重是影响仔猪质量和存活的一个重要性状.本研究利用206头藏猪仔猪群体,提取耳组织样品DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型填充后,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS),筛选该群体的出生重性状相关基因.结果显示:GEMMA软件共检测到5个达到染色体显著水平(P<5.6*10-6)的SNP位点,筛选了TMC1、PRUNE2、FOXB2、XIRP2、ENSSSCG00000005264、ENSSSCG00000022408和ENSSS?CG00000030243作为出生重性状候选基因,为后续通过分子育种手段提升藏猪出生重性状奠定了基础.
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