基于加权共表达网络预测结直肠癌的核心基因

来源 :重庆理工大学学报:自然科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xuzhijiazhz
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研究根据GEO数据库下载的包括17对结直肠癌组织和正常组织的基因芯片数据集GSE32323,对方差前25%的基因进行加权共表达网络分析得到10个模块,然后利用P <0.05选出与结直肠癌显著最相关的2个模块,用DAVID数据库对其进行GO和KEGG富集分析,表明这2个模块主要富集在细胞调控、细胞外泌体、代谢通路和细胞分裂、蛋白结合、细胞周期、P53信号通路等过程。再用Cytoscape对核心模块可视化,根据GEPIA数据库作生存分析,由P <0.05得到PPARG,ACO2,MYC,CCNB2
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