【摘 要】
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目的 应用高通量测序技术分析树鼩大肠细菌的结构与组成。方法 采集3只雄性树鼩大肠内容物,用细菌16SrDNA通用引物扩增V3~V4区,采用Illumina PE250平台测序。结果 共获得160
【机 构】
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昆明医科大学实验动物学部,昆明医科大学技术转移中心,昆明医科大学第一附属医院
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(编号:81460647);云南省应用基础研究计划项目(编号:2017FE468-014,2017FE468016);云南省教育厅科学研究基金项目(编号:2018Y048)
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目的 应用高通量测序技术分析树鼩大肠细菌的结构与组成。方法 采集3只雄性树鼩大肠内容物,用细菌16SrDNA通用引物扩增V3~V4区,采用Illumina PE250平台测序。结果 共获得160 157条有效序列,聚类后得437个运算分类单位(operational taxonomic units,OTUs)。树鼩大肠中的细菌有9个门、19个纲、37个目、68个科、137个属和194个种。其中,①厚壁菌门和变形菌门的丰度最高,分别为63.30%和28.52%;②优势纲是芽孢杆菌纲和γ-变形菌纲(51.46
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