5月11日中午，卫生部通报四川成都确诊首例甲型H1N1流感病例，自此，狙击于国门之外达半月之久的甲型H1N1流感潜入国内。5月13日，山东省又确诊一名甲型H1N1流感病人，同一天，香港也有两人被确诊。面对危机，国家应对突发公共卫生事件紧急预案应声启动，相关部门立即行动起来。
　　控制流感疫情的大范围扩散，交通运输部门可谓中流砥柱，在流感潜入国内前，已成立由三位副部长亲自挂帅，各部门负责人为成员的应急运输领导小组，各地交通运输管理部门和运输企业，亦响应号召，做好了随时投入战斗的准备。
　　


　　当前，交通运输系统从中央到地方，从法规到具体措施，从预算资金到物资储备的全方位准备业已就绪。按照“高度重视，积极应对，联防联控，依法科学处置”的原则，在严格防控甲型H1N1流感对我国造成危害的同时，仍然坚持做好我国关键时期“保增长、保民生、保稳定”的重要任务。
　　稍感欣慰的是，经历过“非典”肆虐、“禽流感”侵扰的中国，在防控此类突发公共卫生事件上，已有一整套完备的体系，此次能狙击“猪流感”于国门之外达半月之久即是一个明证。
　　4月29日，首例流感病人在墨西哥确诊仅5天，中国尚无一例疑似病例的情况下，交通运输部已发出紧急通知，要求按照《突发公共卫生事件交通应急规定》制定应急预案，由各地负责人亲自挂帅，成立应急小组，在当地政府的统一领导下，与卫生、质检等有关部门密切配合、齐心协力做好预防预控工作。
　　5月2日上午，受交通运输部部长李盛霖委托，徐祖远副部长主持召开了“防控甲型H1N1流感疫情专题会”，进一步部署甲型H1N1流感联防联控工作。
　　会议决定成立交通运输部甲型H1N1流感联防联控领导小组，由翁孟勇副部长担任组长，冯正霖副部长和徐祖远副部长担任副组长，相关司局（室）作为领导小组成员单位。
　　领导小组下设综合组、口岸组、保障与防控组、宣传组和机关防控组五个工作小组，主要负责包括工作部署协调、信息沟通联系、进出口岸防控、境内交通防控与保障、新闻发布报道、机关防控等，建立上下联动、左右互动的联防联控工作机制。
　　5月4日，交通运输部发出紧急通知，要求有关省区交通运输主管部门从即日起，每周一和周四14时以前分别报送上周四至周日和本周一至周三的公路口岸防控甲型H1N1流感情况，加强口岸国际道路运输监管，配合卫生检疫部门做好疫情防控工作，以防止疫情通过国际道路运输途径传入我国。
　　要求黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古、新疆、广西、西藏、云南八省区有关单位将防控甲型H1N1流感工作作为当前国际道路运输管理工作的重点，省级道路运输管理机构和口岸交通运输管理站要积极参与口岸联防联控机制，主动配合检验检疫机构做好入境旅客、司乘人员填报《出入境健康申明卡》工作。
　　5月6日上午，李盛霖主持召开部甲型H1N1流感联防联控领导小组会议，传达贯彻国务院常务会议精神，研究部署交通运输系统进一步防控措施。
　　要求遵循“掌握动态、科学预防、措施有力、有序有效”的原则，继续全力以赴配合质检部门做好出入境检验检疫，配合有关部门做好检疫检测设备等应急物资运输，积极制定完善交通运输系统应对疫情发生发展的预案。
　　5月11日下午，我国首例甲型H1N1流感病人刚刚确定，受李盛霖部长委托，翁孟勇、冯正霖共同主持召开交通运输部防控甲型H1N1流感疫情专题会议，迅速传达贯彻国务院常务会议精神，对交通运输系统防控工作进行再部署，提出新要求。
　　这些会议大多无法在正常工作时间召开，领导小组成员必须24小时开机，随叫随到。面对这种重大突发性公共事件时，领导24小时值班制发挥着重大作用。
　　目前，各级地方交通主管部门、运输企业已对有关港站、交通工具等疫情的监测检查工作做好充分准备，发现咳嗽、头痛、发烧等疑似症状人员，将立即通知卫生、质检等部门并采取排查和临时隔离监控措施，同时配合相关部门对相关交通工具进行强制消毒，严防疫情传入。