【摘 要】
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背景:滑膜在骨关节炎的病程发展过程中发挥着重要作用,而铜死亡是近期最新发现的一种新型细胞程序性死亡,目前尚未有从滑膜角度探究铜死亡基因在骨关节炎中的相关机制研究。目的:以滑膜为切入点从铜死亡角度探究影响骨关节炎发生发展的潜在机制。方法:通过GEO数据库检索符合条件的骨关节炎相关芯片,对其进行标准化处理,基于处理后的基因表达矩阵进行铜死亡相关基因提取和量化,通过随机森林树模型、支持向量机模型、机器学
【基金项目】
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广西中医药大学校级项目(YCXJ2021070),项目负责人:熊波;广西中医药大学校级项目(YCXJ2021071),项目负责人:黄悦; 广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2022KY0282),项目负责人:刘金富;
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背景:滑膜在骨关节炎的病程发展过程中发挥着重要作用,而铜死亡是近期最新发现的一种新型细胞程序性死亡,目前尚未有从滑膜角度探究铜死亡基因在骨关节炎中的相关机制研究。目的:以滑膜为切入点从铜死亡角度探究影响骨关节炎发生发展的潜在机制。方法:通过GEO数据库检索符合条件的骨关节炎相关芯片,对其进行标准化处理,基于处理后的基因表达矩阵进行铜死亡相关基因提取和量化,通过随机森林树模型、支持向量机模型、机器学习、列线图模型构建疾病预测模型以预测骨关节炎患病的风险。然后,运用共识聚类算法、主成分分析(PCA)、单样本基因组富集分析(ssGSEA)及免疫浸润分析铜死亡分子亚型与免疫微环境及炎症因子的相关性。结果与结论:(1)首次建立了基于铜死亡特征基因的风险预测模型,由3个铜死亡特征基因(DBT、LIPT1、FDX1)构建的疾病预测模型可以较好预测骨关节炎患病的风险;(2)首次发现骨关节炎患者可分型为两种完全不同的铜死亡分子亚型(族A和族B),族B与Th1/Th2细胞比例失衡高度相关,具有更高的白细胞介素2、白细胞介素4、白细胞介素5表达水平。
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