结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析

来源 :上海交通大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:boli257758
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目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4^+T和CD8^+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测并分析MTB的RDl2区抗原CD8^+T细胞表位的分布情况;利用NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原的CD4^+T细胞表位的分布情况。然后,综合CD4与CD8表位预测,筛选出优势表位肽段。结果通过预测与分析,初步筛选出
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