梨S基因检测芯片的oligo探针设计

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为给梨品种S基因芯片的制备及梨品种自交不亲和性S-RNase基因和S基因型的检测奠定基础,结合已有的对梨自交不亲和S-RNase基因的研究成果及Genbank中梨S-RNase基因信息,利用生物学比对软件Genedoee对梨S-RNase等位基因序列进行比对,得到等位基因HV区的特异序列;用olig06.71、PremierPremier5.0和Clustal.W等生物学软件设计特异性高、解链温度乙值接近、长度均一的oligo探针,获得了24条32mer的oligo探针。
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