基于TCGA数据库代谢相关基因构建乳腺癌预后模型

来源 :实用肿瘤学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wzhqch
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 基于TCGA数据库构建乳腺癌代谢相关预后模型,揭示代谢与乳腺癌预后之间的关系.方法 代谢相关基因从KEGG数据库中获取,limma包用于去筛选TCGA数据库中1109例乳腺癌样本和113例正常对照的代谢相关差异基因,随机抽取70%样本作为训练集,剩余30%样本作为验证集,单因素Cox回归用于筛选预后相关基因,基于glmnet包构建代谢相关预后模型,并通过单因素和多因素Cox回归对模型进行验证.结果 本研究筛选出168个代谢相关差异基因,通过生存过滤及去掉过度拟合的基因后最终13个代谢相关的基因用作预后模型的构建,包括NMNAT2、NT5E、QPRT、UGP2、MTHFD2、TSTA3、TYMP、ALDH2、ALDH1A1、IDO1、IL4I1、INPP1和ENPP6.生存分析显示,高风险组患者生存时间显著长于低风险组(P<0.05).单因素和多因素Cox回归结果表明构建的代谢相关预后模型的风险得分是乳腺癌患者的一个独立预后因素.结论 本研究构建的预后模型揭示了代谢与乳腺癌预后之间的关系,为乳腺癌的诊断及研究提供了一个新的视角.
其他文献
为探究双边箱梁在不同参数条件下剪力滞效应的主要影响因素,以云龙湾大桥为依托,通过现场足尺原位试验,在实桥中布设4个测试截面,结合有限元软件ANSYS,建立全桥梁-壳模型进行对比分析.结果表明:剪力滞系数于双边主梁和主梁顶板交接处达到最大.截面的剪力滞系数从双边箱到桥面中心线呈先减小后增大的变化规律,剪力滞系数于桥面中心线处达到极大值.吊索和横梁能有效减小剪力滞系数;偏心荷载作用时,偏心一侧剪力滞系数明显增大,另一侧显著减小.
目的 观察宫颈癌患者生存与病情进展状态,并探究其影响因素,为改善预后提供依据.方法 本研究纳入2013年1月—2015年12月于哈尔滨医科大学附属肿瘤医院就诊的2306例宫颈癌患者,对其进行回顾和随访,采用Kaplan-Meier法分析宫颈癌患者总生存期(OS)和无进展生存期(PFS),用Cox风险比例回归模型分析生存期影响因素.结果 Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期患者5年生存率分别为87.3%、79.3%、61.8%、36.8%;5年无进展生存率为82.9%、73.0%、55.6%和0.中位随访时间为51.0个月,单