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目的
对2015—2016年冬春季甲型H1N1流感病毒基因特征进行分析。
方法选取上海市长宁区流感网络实验室于2015—2016年流感冬春季流行高峰期分离的甲型H1N1毒株35株,采用RT-PCR扩增其血凝素基因(hemagglutinin,HA)及神经氨酸酶基因(neuraminidase,NA)全长,并对扩增产物进行序列测定。使用MEGA软件计算基因同源性,使用MegAlign软件分析相关抗原和耐药位点,使用NetNGlyc 1.0软件在线预测糖基化位点。
结果35株甲型H1N1流感病毒HA基因分布在Clade 6B.1、6B.2和6C分支上,以Clade 6B.1为主。与2015—2016、2016—2017年北半球推荐的疫苗株A/California/07/2009的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.7%~99.0%和96.7%~98.2%。与2017—2018年疫苗株A/Michigan/45/2015的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.2%~99.3%和97.5%~99.5%;与疫苗株A/California/07/2009相比,35株分离株的HA都发生了抗原位点Sb区S185T位点和Cb区S203T位点突变,33株发生了Sa区K163Q位点突变,7株发生了Cb区Q223R位点突变。受体结合位点和糖基化位点的氨基酸序列均未发生变异。对35株病毒NA基因上9个与耐药有关的基因位点进行分析,1株发生了H274Y位点的改变。
结论2015—2016年冬春季流行的甲型H1N1病毒的HA和NA基因序列改变可能是造成流行高峰的主要原因。