莫西沙星耐药的艰难梭菌多重聚合酶链反应检测和基因分型

来源 :中华传染病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qinzhen
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

建立一种多重PCR方法用于莫西沙星耐药的艰难梭菌鉴定和初步基因分型。

方法

根据艰难梭菌slpA可变区间核苷酸序列的差异设计5种slpA基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的特异性PCR引物,同时加入检测艰难梭菌管家基因磷酸甘油醛异构酶基因tpi的种特异性引物,构建多重PCR方法;利用9种肠道常见的正常或致病菌验证多重PCR方法的特异性,利用46株分属于11个slpA基因型的艰难梭菌参考菌株来验证方法的检测和分型能力;利用建立的多重PCR方法检测39株莫西沙星耐药的临床菌株,以slpA测序分型法为参照方法,评估该方法的临床实用性。

结果

多重PCR检测9种肠道常见的正常或致病菌tpi和5种slpA基因型均为阴性;46株艰难梭菌参考菌株tpi均为阳性,36株分属于5种靶slpA基因型(gr、hr、fr、gc08和078)的菌株被正确分型,10株分属于其他6种基因型的参考菌株均无法分型。39株莫西沙星耐药的艰难梭菌临床菌株tpi均为阳性,32株检出具体基因型,其中22株为slpA基因型gc08,6株为hr,2株为fr,2株为078,与slpA测序分型结果一致;7株多重PCR无法分型,slpA测序分型结果显示其基因型均不包含在多重PCR分型范围内。

结论

成功建立一种简单、快捷、临床实验室适用的艰难梭菌检测,且能够分辨出5种slpA基因型的多重PCR方法;莫西沙星耐药的艰难梭菌主要为slpA基因型gc08。

其他文献
目的探讨新疆维吾尔自治区人民医院急性ST段抬高性心肌梗死(ST-elevation myocardial infarction,STEMI)患者行急诊经皮冠状动脉介入治疗(primary percutaneous coronary intervention,PPCI)的入门-球囊扩张时间(door-to-balloon time,DTBT),并对其影响因素进行分析。方法回顾性分析新疆维吾尔自治区人
目的探讨Algisyl可植入性水凝胶在心力衰竭中的运用及注意事项。方法回顾性分析2015年4月浙江大学医学院附属第二医院心脏中心开展2例Algisyl可植入性水凝胶治疗心力衰竭的手术过程与患者预后情况,并对术前评估、术中操作以及患者术后情况进行总结。结果2例患者严格进行术前评估;术中行全身麻醉、气管插管;由心脏大血管外科医生实施左侧肋间切口,暴露心脏;确认患者的左心室中间水平为注射部位,每个注射点
期刊
目的探讨HBeAg阴性CHB患者在干扰素抗病毒治疗过程中HBsAg水平的变化对治疗中HBsAg消失或血清学转换的预测作用。方法2008年5月至2011年8月于首都医科大学附属北京地坛医院就诊的HBeAg阴性CHB初治患者,HBsAg阳性、血清HBV DNA阳性持续6个月以上,ALT异常3个月以上,收集的患者包括聚乙二醇干扰素-α-2a (peg-IFN-α-2a)治疗3个月以上的在治疗患者和已治疗
目的了解人冠状病毒(HCoV)在上海地区下呼吸道感染住院患儿中的流行情况及临床特点。方法回顾性分析2009年10月至2012年9月因急性下呼吸道感染住院的5岁以下患儿554例,采用Seeplex RV12 ACE试剂盒检测鼻咽分泌物标本中的HCoV以及其他呼吸道病毒。反转录PCR进行HCoV-229E、HCoV-OC43、严重急性呼吸综合征(SARS)-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU
期刊
期刊
期刊
期刊
期刊