【摘 要】
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目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点 (SNPs) 与丙型肝炎病毒 (HCV) 慢性感染的关系.方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组, 353例健康体检者
【机 构】
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中国医学科学院&北京协和医学院 医学生物学研究所, 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室, 云南 昆明 650118昆明市第三人民医院,云南 昆明,650041;
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目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点 (SNPs) 与丙型肝炎病毒 (HCV) 慢性感染的关系.方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组, 353例健康体检者作为对照组, 采用PCR法扩增受检者CCR5基因启动子区基因序列;然后采用Sanger法对扩增序列进行测序并与Gen Bank (NC_000003.12) 序列比较获得与云南省汉族人群具有多态性的SNPs位点, 对获得的SNPs位点进行基因分型, 计算这些SNPs位点的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型并分析遗传模式进行, 比较两组间的分布差异.结果:在CCR5基因启动子区域有9个SNPs位点, 其中rs2227010 (A＞G) 、rs2734648 (T＞G) 、rs1799987 (G＞A) 、rs1799988 (T＞C) 、rs1800023 (G＞A) 及1800024 (C＞T) 6个位点在云南省汉族人群中具有多态性;这6个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率及单倍型频率在病例组与对照组比较, 差异均无统计学意义 (P＞0.05) .结论:CCR5基因启动子中的rs2227010 (A＞G) 、rs2734648 (T＞G) 、rs1799987 (G＞A) 、rs1799988 (T＞C) 、rs1800023 (G＞A) 及1800024 (C＞T) SNPs位点与云南汉族人群HCV慢性感染无关.
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