第三阶段：2005年7月，全国少工委五届一次全委会颁布《少先队辅导员工作纲要（试行）》。对于少先队已开展多年的雏鹰争章活动，重新予以整理，构建了雏鹰奖章的新体系。从小学一年级至初中二年级的8个年级中，共设雏鹰奖章基础章17枚，平均每个学年2枚（五年级有3枚）。
　　同时规定：在小学六年级毕业时，对于获得了小学阶段全部基础奖章的队员颁授1枚“雏鹰奖章银章”；在初中离队时，对于获得了小学和初中阶段全部基础奖章的队员颁授1枚“雏鹰奖章金章”。
　　《少先队辅导员工作纲要（试行）》还明确规定：“在完成好基本任务的基础上，还可以根据实际情况开展特色活动，增设特色奖章。”
　　这一次修订的雏鹰奖章新体系，具有简洁明了、易操作、更加贴近各年级工作任务、更加符合儿童成长规律和教育规律的特点。特色奖章又为基层队组织发挥创造性留下了极大的空间。
　　正基于此，从这之后到2010年全国第六次少代会前后，各地均对此项品牌活动作了针对本地区的规划和调整。
　　第四阶段：2013年3月，继少先队活动课由教育部2012年发文进入课堂后第二年。全国少工委颁布《少先队活动课程指导纲要（试行）》，把“雏鹰奖章”纳入少先队活动课对少先队员的评价之中：
　　设置国家、地方、本校三级“雏鹰奖章”。国家级奖章，设雏鹰奖章年级章1枚、基础章6枚：向日葵章（爱党）、五星红旗章（爱社会主义祖国、国家意识）、接力章（党团队组织意识衔接）、美德章（正直、善良、诚实、有爱心）、成长章（科学意识、劳动意识）、健康章（体魄、心理健康）。每个年级少先队员争得4枚（含）以上基础章即可获1枚年级雏鹰奖章。各年级奖章的颜色分别为赤、橙、黄、绿、青、蓝、紫、金。小学阶段获得全部6枚年级章可颁授1枚雏鹰银章，初中阶段获得2枚年级章可颁授1枚雏鹰金章。
　　同时指出：各级少工委和基层学校少先队组织可在实施国家奖章的基础上，结合当地资源特点和本校特色，根据少先队活动课目标和内容，创设各年级灵活多样的地方奖章和本校奖章。
　　第五阶段：即现行阶段。2015年6月，全国第七次少代会召开。此次会议是在党的十八大（2012年）之后举行，为深入学习贯彻习近平总书记系列重要讲话精神，贯彻落实党中央对当代少年儿童和少先队工作的希望和要求，贯彻落实中央党的群团工作会议精神。
　　2015年9月，全国少工委出台《少先队活动课程指导纲要》（2015年9月试行版），其中确定把“雏鹰奖章”作为对少年儿童激励的主要方式，鼓励少年儿童通过定章、争章、评章、颁章、护章，不断确立新的目标、追求进步。坚持公正、民主、平等，自評、互评、他评相结合，由中、小队和大队组织。