【摘 要】
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目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在医院聚集性感染事件中快速识别感染源的可行性和实用性.方法 收集某院新生儿中心6例发热伴腹泻或皮疹新生儿的咽、肛拭子和血标本,同时期同病室其他新生儿和医护人员(咽、肛拭子)标本,以及环境标本,采用传统培养方法、肠道病毒通用聚合酶链反应(PCR)、mNGS和肠道埃可病毒18(ECO18)型特异性PCR进行检测.结果 6例新生儿血及肛、咽拭子标本细菌培养未检出病原体,肛拭子肠道病毒通用PCR和ECO18型特异性PCR检测均阳性.mNGS从6例新生儿不同标本中至少一份检
【机 构】
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深圳大学医学部生物医学工程学院 广东省生物医学信息检测与超声成像重点实验室,广东 深圳 518052;华中科技大学协和深圳医院 深圳大学医学部第六附属医院感染科,广东 深圳 518052;华中科技大学
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目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在医院聚集性感染事件中快速识别感染源的可行性和实用性.方法 收集某院新生儿中心6例发热伴腹泻或皮疹新生儿的咽、肛拭子和血标本,同时期同病室其他新生儿和医护人员(咽、肛拭子)标本,以及环境标本,采用传统培养方法、肠道病毒通用聚合酶链反应(PCR)、mNGS和肠道埃可病毒18(ECO18)型特异性PCR进行检测.结果 6例新生儿血及肛、咽拭子标本细菌培养未检出病原体,肛拭子肠道病毒通用PCR和ECO18型特异性PCR检测均阳性.mNGS从6例新生儿不同标本中至少一份检出ECO18型病原体,阳性率由高至低依次为肛拭子(66.66％)、血(50.00％)和口咽拭子(0).采用mNGS检测同时期同病房18例无症状新生儿咽和肛拭子标本,2例新生儿肛拭子标本ECO18型检测阳性.医务人员以及环境标本未检出ECO18型或其他肠道病毒.结论 mNGS可检测出ECO18型感染患者粪便或血清中低拷贝数的ECO18型病毒,是一种有效的辅助性诊断肠道病毒感染的方法,并且具有追溯医院聚集性肠道病毒感染病原体的潜力.
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