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1、农业科研综合实力相对薄弱。长期以来福建列入国家科技攻关课题不多、争取经费少；常规技术研究多、高新技术研究少；技术引进多、吸收消化、形成自主知识产权的技术成果少；设备陈旧、图书资料少、现代信息手段也比较缺乏，大面积综合实验基地少，致使近几年来农业科研进展缓慢，科技储备严重不足。创新成果与世界先进国家和地区相比，还有较大的差距。如动植物转基因工程、农林作物育种与先进国家相比落后15-20年，农作物优良种苗后续资源不足，许多品种开始老化；生物农药创新和生产技术水平相差10-15年；畜禽病毒学和免疫学诊断方法