论文部分内容阅读
组成蛋白质的基本单位是氨基酸，对于蛋白质分类预测问题，氨基酸序列特征提取方法是一个非常重要的因素。对基于氨基酸组成、位置的特征提取算法如熵密度、n阶耦联组成和基于氨基酸性质的特征提取方法如自相关函数、伪氨基酸组成等方法进行了阐述，并进行了简单评价。基于氨基酸组成的方法实现简单、计算量小，且对所有的氨基酸序列都适用，但丢失了氨基酸的顺序信息以及其问的相互作用，基于氨基酸位置信息或理化特性等方法计算量非常大，科研工作者可以根据对蛋白质的不同要求选择相应的特征提取方法。