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报道了以新鲜嫩叶提取高纯度、完整性好的柱花草基因组DNA方法。并利用正交设计，从Taq聚合酶、Mg^2＋、dNTP、DNA模板、引物浓度5个因素、4个水平对柱花草ISSR反应体系进行优化试验，确立了适合柱花草的快速而义高效的ISSR反应体系，即20μL反应体系中含1×PCR缓冲液，2．0mmol／L Mg^2＋，0．2mmol／L dNTP，0．4μmol／L引物，60ngDNA模板，1UTaq聚合酶。