作为一家国有控股公司，公司一直严格按照相关法律法规及监管机构的要求，建立了较为完善的公司治理结构。在公司治理结构中，董事会发挥着关键性作用。董事会对内作为连接股东大会和经营层的桥梁，行使公司章程赋予的相应职权，对外接受中国证监会、上海证券交易所等监管机构的管理，在人员配置、制度、职能运作等方面都需合理且高效。
　　公司董事会共9名成员，其中独立董事3名，职工董事1名。独立董事参与公司经营决策事宜，有利于公司决策更加专业、客观和高效。公司确保独立董事除具有独立董事的职权外，还赋予了一些特别职权，对一些事项向董事会或股东大会发表独立意见，以维护公司整体利益，尤其保护中小股东合法权益不受侵害;职工董事参与企业的决策、管理和监督，不僅有利于正确决策，而且在决策实施过程中，能够充分调动广大职工的积极性，有利于提高决策水平。
　　2017年，黑牡丹通过制定新一轮发展战略规划，明确了集团的下一步发展方向及各子公司的发展定位，形成战略协同格局，促进各板块协调发展、实现集团价值最大化。同时，对内稳步提升管理效能。整合组织结构，提升组织运营效能，减少运营内部消耗，节省运营成本。优化和完善管理制度，为决策提供制度支撑。扎实推进内控体系建设，发现问题及时落实整改，保证公司内控上依法合规。
　　在鼓励创新发展方面，公司已在《公司章程》中明确了“公司建立鼓励创新的容错机制，在符合法律、法规、政策和公司制度的前提下，创新项目未能实现预期目标，且未牟取私利、勤勉尽责的，经履行相关程序后，不对相关人员做负面评价。董事、总裁及其他经营班子人员参与经审批的创新项目适用上述容错机制。”