随着改革进程的不断深化，事业单位发展所面临的竞争压力不断加大。为了提高整体管理水平，向社会提供更加优质的公共服务，确保单位实现稳健运行，事业单位必须积极引入现代化管理模式和手段，加强内部管理体系革新，预算管理的重要性越发凸显。预算管理的有效落实有利于事业单位提高内部管理制度，目前，事业单位在预算管理层面已取得一定成效，但仍存在较多问题。预算绩效管理的有效落实有利于事业单位提高预算管理水平。但从当前实际情况来看，我国对于预算绩效管理的研究与应用时间相对较短，缺少充足的工作经验，导致单位在实际工作中不可避免地面临各种各样的问题，所以，如何有效解决预算绩效管理工作中存在的问题已经成为当下事业单位发展亟须解决的重难点问题之一。基于此，本文以预算绩效管理为研究主题，从其对事业单位发展的意义着手，研究单位在实际实施过程中可能存在的难点，以此为基础，提出相应的应对建议和措施，以期对事业单位发展有所借鉴。