【摘 要】
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目的:研制快速检测牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)、牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas endodontalis,Pe)、中间普氏菌(Prevotella intermedia,Pi)和变黑普氏菌(Pr
【机 构】
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中国药科大学药学院,江苏,南京,210009;中国科学院上海微系统与信息技术研究所生物芯片实验室;上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院牙体牙髓科;上海市口腔医学研究所
【基金项目】
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上海市教委资助项目;国家自然科学基金
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目的:研制快速检测牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)、牙髓卟啉单胞菌(Porphyromonas endodontalis,Pe)、中间普氏菌(Prevotella intermedia,Pi)和变黑普氏菌(Prevotella nigrescens,Pn)的芯片系统.方法:利用Genebank中细菌16 S rDNA保守区序列,设计一对通用引物;通过已知Pg、Pe、Pi和Pn的16 S rDNA可变区序列,设计合成对应的特异性寡核苷酸探针.先用通用引物PCR扩增所有标准菌株的DNA并作荧光标记,PCR产物和已点样有Pg、Pe、Pi和Pn4种探针的芯片杂交,并用荧光扫描仪进行分析.结果:芯片上的Pg、Pe、Pi和Pn 4种探针只与相对应的Pg、Pe、Pi和Pn的PCR产物反应,而与其他标准菌株的PCR产物无反应.结论:应用16S rDNA基因芯片可以准确检测Pg、Pe、Pi和Pn,快速、灵敏、特异性高,有望在临床上得到应用.
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