恙虫病东方体山东分离株Sta56基因全序列扩增及酶切分析

来源 :中华流行病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lan_lang_
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目的 明确山东恙虫病东方体(Ot)分离株Sta56基因全序列与其他已知的序列之间的遗传变异关系.方法 对从山东省费县恙虫病患者、黑线姬鼠、小盾纤恙螨体内分离的3株Ot分离株Sta56基因全序列进行聚合酶链反应(PCR)扩增;选取4种内切酶HinfⅠ、Hha Ⅰ、HaeⅢ、Pst Ⅰ对PCR扩增产物进行限制性片段长度多态性分析(RFLP);对代表株XDM2株Sta56基因全序列测序,运用Clustal X(5.0)和PHYLIP软件对测得的序列与GenBank中已知的Ot序列构建系统发育树,进行比较分析.结果 患者分离株B-16、黑线姬鼠分离株FXS2和小盾纤恙螨分离株XDM2均扩增出接近1.6 kbp的目的条带.Ot山东分离株PCR扩增产物经HhaⅠ、HinfⅠ、HaeⅢ、PstⅠ酶切后图谱一致,但与国际参考株Glliam、Karp、Kato株的RFLP图谱均不相同;虽与日本地方株Kawasaki株的酶切图谱有相似之处,但存在酶切位点的突变.序列同源性分析结果显示,山东地区代表株XDM2株Sta56基因全序列与Kawasaki型相应的序列同源性最高,为97%,氨基酸序列同源性为92%.结论 经Sta56基因全序列分析,Ot山东分离株基因型虽与日本Kawasaki型相似,但也存在差异。

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