论文部分内容阅读
目的 通过网络药理学的方法探讨归肾丸治疗卵巢早衰的信号通路,并预测其可能的作用机制.方法 通过计算系统生物学实验室(TCMSP)检索归肾丸中熟地黄、菟丝子、山药、枸杞、山茱萸、杜仲、当归、茯苓等8味中药组成的化合物,设置口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18筛选药物的有效活性成分及对应靶点;利用Genecards数据库、OMIM数据库获取卵巢早衰的疾病靶点基因;通过venny R软件获取药物-疾病的179个交集作用靶点,并输入String数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”的可视化网络;通过Enrichr数据库、David 6.8数据库进行基因本体(G0)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.结果 归肾丸中药物组成的活性成分有121个,卵巢早衰的疾病靶点有4131个;通过Venny软件得到179个交集靶点,归肾丸治疗卵巢早衰的映射率为4.3%;将179个交集靶点导入String数据库得到由164个节点(node)、673条边(edge)构成的平均节点度为7.52、平均局部聚类系数为0.476的“药物-疾病”蛋白互作网络图;GO富集分析通过Enrichr数据库共得到146条富集结果(P<0.01),并选取靠前排名20位的富集结果绘图;通过David 6.8数据库进行GO功能注释分析,设置P<O.01,结果显示涉及70个生物过程(BP)、15个细胞组分(CC)、21个分子功能(MF);KEGG信号通路富集分析利用David数据库筛选相关信号通路富集结果,共获得144条信号通路(P<0.01),绘制排名靠前20位的信号通路气泡图.结论 归肾丸可能通过多成分、多靶点、多通路实现改善卵巢早衰的作用,为进一步的实验研究及临床运用提供了思路和理论依据.