保护区位于青藏高原腹地，青海南部。
　　是中国面积最大的自然保护区，也是世界高海拔地区生物多样性最集中和生态最敏感地区。
　　2000年8月19日，三江源自然保护区纪念碑正式落成揭碑，标志着三江源自然保护区正式成立。
　　2016年6月，三江源国家公园管理局在西宁挂牌成立，三江源国家公园是我国第一个国家公园，范围包括青海可可西里国家级自然保护区，及三江源国家级自然保护区的扎陵湖、鄂陵湖、星星海等地。
　　三江源自然保护区河流密布，湖泊、沼泽众多，雪山冰川广布，是世界上海拔最高、面积最大、分布最集中的地区，湿地总面积占保护区总面积的24%。
　　三江源是中国面积最大的自然保护区，是海拔最高的天然湿地，平均海拔4000多米。它是长江、黄河、澜沧江三条大河的发源地，素有中华水塔之美誉。
　　历史上，三江源區曾是野生动物种群繁多的高原草原草甸区，被称为生态“处女地”。然而随着全球气候变暖，冰川、雪山逐年萎缩，直接影响高原湖泊和湿地的水源补给，众多的湖泊、湿地面积缩小甚至干涸，沼泽地
　　河流：三江源区有大小河流180多条。外流河主要是通天河、黄河、澜沧江（上游称扎曲）三大水系，支流由雅砻江、当曲、卡日曲、孜曲、结曲等大小河川并列组成。
　　湖泊：三江源区是一个多湖泊地区，大小湖泊1800余个，淡水湖和微咸水湖148个，总面积2623 平方公里。盐湖共计28个。列入中国重要湿地名录的有扎陵湖、鄂陵湖、玛多湖等。其中扎陵湖、鄂陵湖是黄河干流上最大的两个淡水湖，具有巨大的调节水量功能。
　　沼泽：三江源自然保护区环境严酷，自然沼泽类型独特，在黄河源、长江的沱沱河、楚玛尔河、当曲河三源头、澜沧江河源都有大片沼泽发育，成为中国最大的天然沼泽分布区，总面积达6.66万平方公里。
　　雪山冰川：三江源内雪山、冰川约2400平方公里，冰川资源蕴藏量达2000亿立方米，现代冰川均属大陆性山地冰川。以当曲流域冰川覆盖面积最大，沱沱河流域次之，楚玛尔河流域最小，冰川总面积1247 平方公里，冰川年消融量约9.89 立方米。
　　地下水：三江源区地下水资源也比较丰富，仅玉树州的地下水贮量就约达115亿立方米，补给方式主要为降水的垂直补给和冰雪融水。