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计算、算法与复杂性研究有着密切的关系，计算方法已经上升为一种复杂性研究的科学方法。计算复杂性使用的研究方法基本上是计算方法，算法复杂性研究的算法描述也是一种计算方法。计算方法还在复杂适应系统理论、人工生命等复杂性分支学科中扮演了重要的角色。计算方法不但在复杂性研究中有重要的作用，而且在一般方法论意义上也已经变得不可或缺，甚至走向了计算主义。