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提出一种新的基因序列图形表达方法及特征参数Z_Inv,这种图形表达不仅具有良好的非退化特征,而且充分保留了基因序列的生物学特征。通过实验比较分析,特征参数Z_Inv具有计算简单且比其他不变量更接近于矩阵最大特征值不变量λ。最后将这一图形表达及特征参数应用于基因序列的相似性分析中。实验结果表明,利用图形表达及其特征参数的基因序列形似性分析具有较好的合理性。