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针对X射线脉冲星信号信噪比低，难以获取精确脉冲星信号相位的问题，提出了基于Wavelet-Fisz变换的X射线脉冲星信号的估计方法．根据X射线脉冲星信号特性建立了信号模型，推导了Wavelet—Fisz变换理论，利用该变换将X射线脉冲星信号逼近于高斯分布，对变换后的信号数据进行估计．对大量RXTE的实测数据进行分析，结果表明在Wavelet—Fisz变换下能获得较好的估计性能，且耗时小，有利于X射线脉冲星导航的工程应用．