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磨盘山水库饮用水工程将有艰巨的水源地水质保护任务。磨盘山饮用水源地存在的潜在环境问题，包括旅游开发对饮用水源地将构成威胁：面源污染将影响水库水质；保护区内开荒种田破环水质和森林植被仍在减少等。建议在加强磨盘山水库饮用水源保护方面进一步加强科学研究工作，尽快制定和完善相关法规体系，尽快出台水源地保护区划分。