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癌基因组的体细胞突变扫查数据为研究人员发现新的癌基因提供了大量的信息。已有的通过基因突变频率寻找候选癌基因的方法倾向于发现突变频率较高的癌基因，但是部分低频率突变的基因也可能在癌症发生过程中发挥重要作用。具有相似系统发生谱并且具有蛋白互作关系的基因可能具有相似的功能，它们的损伤可能会导致相同或相似的疾病表型。基于这一假设，文章提出了一种发现候选癌基因的新方法。首先，寻找具有相似系统发生谱的蛋白质互作子网，定义为共进化基因模块；然后，在癌基因组中发生至少一次非同义体细胞突变的基因中，筛选出与已知癌基因在同一