【摘 要】
:
目的:分析骨髓增生异常综合征(MDS)患者骨髓肿瘤DNA(BM-tDNA)与外周血浆循环肿瘤DNA(PP-ctDNA)突变位点的一致性。方法:用NGS 127-gene panel的骨髓与外周血同期送检者(19例)
【机 构】
:
中国中医科学院西苑医院血液科; 中国中医科学院研究生院; 安诺优达基因科技(北京)有限公司; Divisions of Pathology andExperimental
【基金项目】
:
国家自然科学基金项目(81673821,81774142);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(ZZ10-016)
论文部分内容阅读
目的:分析骨髓增生异常综合征(MDS)患者骨髓肿瘤DNA(BM-tDNA)与外周血浆循环肿瘤DNA(PP-ctDNA)突变位点的一致性。方法:用NGS 127-gene panel的骨髓与外周血同期送检者(19例)检测肿瘤DNA,分析BM-tDNA与PP-ctDNA突变位点VAF的一致性。随机加测其中5例患者外周血细胞的肿瘤DNA(PC-t DNA),并分析PC-tDNA与PP-ctDNA以及BM-tDNA突变位点VAF的一致性。另外检测和分析13例非同期送检患者PP-ctDNA与BM-tDNA的VAF差值,并与同期患者PP-ctDNA与BM-tDNA VAF差值进行比较。结果:同期(19例)与非同期(13例)患者人均PP-ctDNA浓度分别为0.59 ng/μl和0.604 ng/μl,其中位数浓度分别为0.330 ng/μl和0.338 ng/μl。19例同期送检患者BM-tDNA与PP-ctDNA交集位点的VAF有较好的一致性(R~2=0.9693;P<0.05),其中单碱基置换(SNP)位点VAF的一致性(R~2=0.9712)较插入缺失(Indel)位点为好(R~2=0.6813),BM-tDNA与PP-ctDNA中有临床意义的位点的检出率和VAF均有较好的一致性(R~2=0.9203,P<0.05)。19例同期送检患者中,12例初诊(R~2=0.9325,P<0.05)和5例治疗后(R~2=0.9875,P<0.05)患者BM-tDNA与PP-ctDNA的VAF均有较好的一致性。随机加测其中5例患者的PC-tDNA结果显示,PC-tDNA与PP-ctDNA(R~2=0.8783)以及BM-tDNA(R~2=0.9633)突变位点的VAF均有较好的一致性(P<0.05)。与19例同期送检患者相比,13例非同期送检BM-tDNA与PP-ctDNA VAF差值显著增大(P<0.05)。结论:PP-ctDNA浓度稳定,临床有意义位点与BM-tDNA一致性高,样本容易采集,可代替骨髓作为基因检测的生物样本。
其他文献
作为一种象形文字,汉字言文分离的特点深刻塑造了汉语文化的品格和特质,某种程度上也造成了和西方拼音文明的差距。但是在网络赛博空间里,汉语文化保留完整的"声觉空间"和独
日本战犯对侵华战争的建构建立在体验的个体性中,虽然他们对战争的认识还有片面之处,但总体而言,他们对侵华战争侵略事实的见证是良知的发现,是付诸于行动的反省。他们描写的
随着工业时代向信息时代发展,新的竞争规则不断涌现,企业需要对市场变化做出快速反应,企业在激烈的市场竞争中能否成功越来越取决于其获取和利用无形资产(技能、系统、价值)
中国戏曲长于从伦理道德方位观察社会生活、塑造人物形象,家庭伦理生活尤为戏曲作家所关注,元代戏曲中以“家长里短”为题材的剧作占有相当大的比重。这类剧作多以家庭伦理关
<正>2018年11月17-18日,中国高等院校影视学会第十八届年会暨第十一届中国影视高层论坛在广东广州盛大举行。来自中国广播电影电视社会组织联合会、中国文学艺术界联合会、中
随着世界经济和金融形势的变化,中国与国际市场的逐渐融合,我国企业的外汇风险暴露问题也日益突出。这就使得我们必须对我国企业的外汇风险暴露问题进行研究。 本文首先对
随着网络技术的发展,网络的应用越来越广,对网络通信的可靠性和安全性的要求也越来越高。IPSec技术是为在IP层提供通信安全而制定的一套协议族,对IP数据包进行封装,保证网内
本文主要讲的是在城市规划与管理中利用GIS技术对城市历史文化遗产信息进行分析的理论、方法及实例。首先,作者从城市遗产保护者和城市规划者的两个视角重新审视了“城市遗产
我们在世界文学史中可以发现许多以“家”为主题的文学作品。这在近代的中日文坛,特别是社会变革即将发生之际,尤为多见。这些作品主要集中在日本的明治四十年代和中国的一九
近年来,将新闻娱乐化已经成为全球范围内媒体惯用的一种表现手法:软新闻大肆蔓延,媒体纷纷将犯罪新闻、丑闻事件、暴力事件、灾害事件、体育新闻、名人趣事及花边新闻等软性