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2020年9月24日我院呼吸内科收治1例重症社区获得性肺炎(Severe Community Acquired Pneumonia,SCAP)患者,由于各医院缺乏可准确诊断罕见病原体的方法,故临床CAP很少有关鹦鹉热衣原体(Chlamydia psittaci,Cps)的报道[1]。该患者通过宏基因组二代测序法(Next-generation sequencing,NGS)确诊为鹦鹉热衣原体重症社区获得性肺炎,诊治过程顺利,转归满意。现报道如下。