【摘 要】
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为开发大量的思茅松SNP标记，本研究以思茅松两亲本和100个杂交的Fl代遗传群体为研究对象，利用SLAF–seq测序技术进行测序。选择HaeIII酶进行酶切，长度在414～464 bp之间的酶切片段定义为SLAF标签，然后每个样本和标签序列比对，以获得不同样本的SNP标记信息。结果表明，建库双端比对效率在84.91%，酶切效率为95.52%，SLAF建库正常。共获得507 394 471个数据，测
【机 构】
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西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31500536）资助；
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为开发大量的思茅松SNP标记，本研究以思茅松两亲本和100个杂交的Fl代遗传群体为研究对象，利用SLAF–seq测序技术进行测序。选择HaeIII酶进行酶切，长度在414～464 bp之间的酶切片段定义为SLAF标签，然后每个样本和标签序列比对，以获得不同样本的SNP标记信息。结果表明，建库双端比对效率在84.91%，酶切效率为95.52%，SLAF建库正常。共获得507 394 471个数据，测序平均Q30为92.25%，GC含量为40.23%，分布正常。共获得633 086个SLAF标签，其中多态性SLAF标签有239 790个，共有140 485个标签成功编码，共开发获得11 544个SNP标记。本研究结果可以对思茅松优良基因实行精细定位，为筛选优其优良性状性、种质资源的鉴定和群体进化等相关研究提供新的依据。
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