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目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定，采用x^2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型，评价各位点的分辨力。构建N—J树分析其系统进化；构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构；采用分子方差分析不同谱系MTB的群体间遗传分化；采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果通过LSP可将413株MTB分为两大谱系，其中北京谱系占56．2％（232／413），