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随着社会主义市场经济体制的逐步建立，事业单位的性质、财务管理和内外部环境已发生了根本性的变化，1996年财政部颁布实施了《事业单位财务规则》，改变了原来单一由财政补贴经费形式为事业单位依据国家政策，依法组织收入，逐步建立了在国家规定范围内多渠道筹集资金、多种形式发展事业的格局。但政府包办社会、包揽非公益事务、财政支出越位、按行政模式管理事业单位的弊端也逐步暴露出来，事业单位财政补助存在的问题集中表现在以下方面：