普通烟草MATE基因家族分析及功能预测

来源 :植物遗传资源学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:abing206
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
植物多药和有毒化合物排出家族(MATE,multidrug and toxic compound extrusion)是一类可转运毒素、金属离子、次级代谢产物的次级转运蛋白家族。该家族主要在植物的解毒机制中发挥作用,部分成员也参与植物的形态建成过程。MATE家族在烟草基因组中的数量、特征及功能目前尚未开展系统分析。本研究利用生物信息学方法对普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中的MATE基因进行了预测分析,共预测到131个基因,分为4个亚家族。亚家族3在进化树中形成较为独立的分枝,其跨膜区数量、亚细胞定位、保守结构域方面与其他亚家族不同。转录组数据显示,相当一部分MATE家族基因在所有组织中低量表达。GO功能注释结果表明该家族成员主要作为一种转运体,在应激响应、生物调控等过程中发挥作用。本研究为烟草及其他植物中MATE家族的鉴定和功能研究提供了数据基础。
其他文献
杰克·凯鲁亚克的代表作“垮掉派的圣经”《在路上》,记录了垮掉一代的不羁生活。他们狂欢式的生活表态下隐藏的是“垮掉一代”对第二次世界大战后压抑的社会的反抗,以及
面对新形势高等专业对人才的需求,针对水文与水资源工程专业特点,结合校实验教学中心的建设,从实验教学内容、教学方法和手段、实验考核评价机制等几个方面提出了专业实验教
清政府从康熙七年(1668年)开始,为了保存它的“龙兴之地”,对东北地区尤其是黑龙江和吉林采取了严厉的封禁政策,这种人为的限制,严重阻碍了黑龙江地区的开发,是造成黑龙江地