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对邛海湖湿地浮游藻类的种类及分布状况进行了调查，结果表明，该湿地现有浮游藻类102种（含1变种），隶属于8门45科69属。其中绿藻门25属34种1变种，蓝藻门16属23种，硅藻门13属19种，裸藻门5属12种，黄藻门4属5种，甲藻门3属3种，金藻门2属3种，隐藻门1属2种。根据浮游植物指示种评价，邛海湿地水质属于α-中污和β-中污。